上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院仁濟(jì)醫(yī)院消化學(xué)科是以上海市消化疾病研究所（1984年由江紹基院士和蕭樹東教授共同創(chuàng)建的國內(nèi)第一個(gè)消化疾病研究所）的臨床和基礎(chǔ)部分為主體組成。系國家重點(diǎn)學(xué)科牽頭單位（1989年起至今）、國家臨床重點(diǎn)專科（消化內(nèi)科，衛(wèi)生部評審非部隊(duì)醫(yī)院排名第一）、國家臨床重點(diǎn)專科（衛(wèi)生部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室）、國家211工程重點(diǎn)學(xué)科、上海市重點(diǎn)學(xué)科（消化內(nèi)科，優(yōu)勢學(xué)科，本市唯一）、衛(wèi)生部消化內(nèi)科重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室（國內(nèi)唯一）、上海市消化內(nèi)科臨床醫(yī)學(xué)中心（本市唯一）和上海市"重中之重"臨床醫(yī)學(xué)中心（A 類，上海全部臨床學(xué)科只有10家，消化內(nèi)科唯一）、上海市消化內(nèi)科臨床質(zhì)量控制中心（本市唯一）。同時(shí)還是中華醫(yī)學(xué)會消化病學(xué)分會官方網(wǎng)站《中華消化網(wǎng)》的承擔(dān)單位。